Offline Sorter x64 V4 常用操作
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Offline Sorter x64 V4 常用操作

此文记录Offline Sorter(下简写为OFS)的常用操作,本文所有操作都在demo数据上完成

Plexon官网链接:Plexon

下载链接:Offline Sorter v4.7.1 – Windows 10 (64 bit)

操作过程中遇到任何问题,或是需要了解更详细的操作方式,查阅官方文档

基础操作

该部分简述OFS的基础操作

数据导入

OFS_1|500

点击工具栏中File, 再点击open

OFS_2|500

右下角可以查看OFS支持的文件类型, 此处我么们选择打开4chDemoPL2.pl2数据

OFS_3|500

打开后界面如上图所示

数据查看

OFS_4|500

关注右侧该部分,该部分展示数据的相关信息,例如通道信息, 事件信息等

  • Channels:展示数据的每个通道的信息
    • Name:通道名称,该名称在不同的数据存储格式中不一定相同,该份数据中,SPK表示高频通道,WB表示原始数据,FP表示低频通道
    • Samples:采样个数
    • Waveforms:detect出来的waveform的数量
    • Unsorted:识别不出来的waveforms的数量
    • Unit x:识别为细胞x的waveforms的数量

双击Name部分,可以看到该通道的具体波形等更详细数据,此处双击WB01,结果如下图所示

OFS_5|500

Timeline区域展现该通道的具体波形

OFS_6|500

  1. 可以调节时间窗大小
  2. 将鼠标放置在波形区域,可以查看该点对应的时间、幅值等信息

Sort流程

该部分简述如何利用OFS进行sort操作

滤波

在选择具体通道后, 点击Waveforms后点击Filter Continuous Data...

OFS_7|500

随后根据需求选择具体滤波方法并调整相关参数,此处以图中所示方法和参数进行操作

OFS_8|292

点击OK后得到结果如下图所示

OFS_9|500

detect

识别波形中的spike

点击Waveforms后点击Detect...

OFS_10|500

随后根据需求调整相关参数,此处以图中所示方法和参数进行操作

OFS_11|449

点击上图的Set Waveform Detection Options...,也可以调整从spike到waveform的相关参数

OFS_12|442

点击Detect后得到结果如下图所示

OFS_13|500

点击Zoom In, 缩小时间窗,我们可以看到识别出来的单个波形

OFS_14|500

此处展示识别出来的波形的叠加

OFS_15|500

此处展示聚类图

OFS_16|405

sort

点击Sort后点击Perform Automatic Sorting...

OFS_17|500

随后根据需求调整相关参数,此处以图中所示方法和参数进行操作

OFS_18|500

点击OK后得到结果如下图所示

OFS_19|500

可以看到,已经识别出来多个细胞,在聚类图和波形图中用不同颜色进行表示,且在通道信息部分也表现出了细胞的spike数

其它

数据导出

注:该操作需要加密狗

点击File后可以看到许多Export选项

OFS_20|500

sort结果summary

依次点击Tools, Options..., Stats, 勾选红框中的选项

OFS_21|500

OFS_22|500

随后再依次点击View, Sorting Summary

OFS_23|500

可以看到包括细胞种类, spike数量, 所选方法及相关参数, L-Ratio, Iso, SNR 等信息

OFS_24|500

info grid views

在此处可以看到更多详细信息

OFS_25|500

mat导入

注:该操作需要加密狗

官方教学

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